Typing of Mycobacterium bovis isolates from cattle using MIRU-VNTR analysis

Authors : Yasin GÜLCÜ, Hasan Hüseyin HADİMLİ

Pages : 133-139

Doi:10.35864/evmd.819195

View : 17 | Download : 11

Publication Date : 2020-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Sadece hayvan sağlığı değil aynı zamanda halk sağlığı açısından da önem arz eden sığır tüberkülozu, dünya genelinde yaygın olan zoonotik bir hastalıktır. Moleküler epidemiyolojinin ortaya çıkışıyla, hastalığın yayılma dinamiğinin anlaşılması ve daha etkili mücadele yöntemlerinin geliştirilebilmesinin temelleri atılmıştır. Bu çalışmada, bölgemizdeki Mycobacterium bovis izolatlarının genotip düzeyinde tanımlanması amaçlandı. Çalışmaya, Konya’daki kesimhanelerden alınan veya Konya Veteriner Kontrol Enstitüsü’ne teşhis için gönderilen tüberküloz şüpheli sığır doku ve organlarından klasik metotlarla izole edilen ve moleküler metotlar ile tanımlanan M. bovis suşlarının genotiplendirilmesi sonucu moleküler epidemiyolojik özellikleri belirlendi. Toplam 70 M. bovis izolatının, MIRU-VNTR yöntemi ile yapılan analizi sonucu; MIRU2, MIRU4, MIRU20, MIRU23, MIRU24, MIRU27 ve MIRU39 lokuslarındaki tekrar sayılarının suşlar arasında farklılık göstermediği, MIRU10, MIRU16, MIRU26, MIRU31 ve MIRU40 lokuslarındaki tekrar sayılarının ise suşlar arasında farklılık gösterdiği ve yüksek ayrım gücüne sahip olduğu (0.25≤h) ortaya kondu. Ayrıca izolat sayısı 1-14 arasında değişen 29 altgrup oluştuğu görüldü. Bölgemizde farklı sebepler ile yaşanan hayvan hareketliliğinin, M. bovis suşlarının sürüler arasında farklılık göstermesine, çalışmamızda ki izolatların kaynağı olan sığırların da farklı sürülere ait olmasının MIRU lokuslarında ayrım gücü çeşitliliğinin ortaya çıkmasına neden olduğu kanaatine varılmıştır.
Keywords : MIRU VNTR, moleküler tiplendirme, Mycobacterium bovis, Sığır tüberkülozu