Sığır karkas orijinli Escherichia coli O157 izolatlarının rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu ile genotiplendirilmesi

Authors : Ertan Emek ONUK, Gökhan İNAT, Arzu FINDIK, İnci Ülkü ÇELİKEL, Alper ÇİFTCİ

Pages : 79-84

View : 25 | Download : 9

Publication Date : 2010-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışma, sığır karkas orijinli 32 adet Escherichia coli O157 izolatının iki farklı random primerin (M13 ve ERIC2) kullanıldığı rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu (RAPD-PCR) metodu ile genotiplendirilmesi ve farklı primer bağlanma ısılarının (32, 36, 38 ve 40°C) RAPD bant paternleri üzerine etkisinin değerlendirilmesi amacıyla yapılmıştır. İzolatlar M13 primeri ile 7, ERIC2 primeri ile 5 farklı genotip içerisinde dağıldı. Çalışmada kullanılan primer bağlanma ısılarının RAPD bant paternlerinin çeşitliliğini dikkate değer bir şekilde etkilemediği görüldü. Sonuç olarak E. coli O157 izolatları arasındaki çeşitliliklerin belirlenmesinde M13 primerinin daha uygun olduğu ve epidemiyolojik çalışmalarda kullanılabilir olduğu belirlendi.
Keywords : Alper ÇİFTCİ, İnci Ülkü ÇELİKEL, Arzu FINDIK, Ertan Emek ONUK, Gökhan İNAT, Escherichia coli O157, genotiplendirme, primer bağlanma ısısı, RAPD PCR, 2010, Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi