Salmonella spp. tespiti için ilmiğe dayalı izotermal amplifikasyon (LAMP) ile kombine üç boyutlu (3B) yazıcıda mikroakışkan çip imalatı

Authors : Meltem ERYILDIZ, Vildan BİLGİC, Seda EKİCİ, Akin YIĞIN, Mehmet DEMİRCİ

Pages : 64-69

Doi:10.35864/evmd.1145433

View : 19 | Download : 9

Publication Date : 2022-12-23

Article Type : Research Paper

Abstract :Gıda ve çevresel kaynaklarda Salmonella\`nın hızlı, güvenilir ve hassas tespiti, halk sağlığını korumak için çok önemlidir. LAMP yöntemi özel cihazlara ve deneyimli personele ihtiyaç duymaksızın uygulanabilecek bir yöntem olduğu için son yıllarda sıklıkla tercih edilmektedir. LAMP’ın, mikroakışkan cihazlarla kombine edilmesi sınırlı kaynakların olduğu durumlarda, hızlı tanı testleri için bir alternatifdir. Salmonella spp. tespiti için, üç boyutlu yazıcıda biyouyumlu PLA filament kullanılarak mikroakışkan çip oluşturularak, ilmiğe dayalı izotermal amplifikasyon yöntemi ile kombine edilmesi amaçlanmıştır. Mikroakışkan çipler CATIA V5 programı kullanılarak tasarlandı insert ignore into journalissuearticles values(Çip boyutları 15x12.5x2.4 mm, kanal çapı 850 µm); ve PLA filament kullanılarak 3B yazıcıda üretildi. Salmonella spesifik LAMP reaksiyonları için InvA geni seçildi. Mikroakışkan çipler için kuru ısı bloğu kullanıldı ve LAMP protokolü 65℃’da 30 dak.’ydı. Testin duyarlılık, özgüllük, PPD ve NPD ölçümleri gerçekleştirildi. Kültür yöntemi ile Salmonella pozitif saptanan 25 pozitif numune arasında, mikrosantrifüj tüpünde uygulanan LAMP reaksiyonu ile sadece bir numunede yalancı negatif sonuc saptanmışken, mikroakışkan çip üstünde uygulanan LAMP reaksiyonunda ise iki numune yalancı negatif olarak tespit edildi. Sonuç olarak; verilerimiz LAMP reaksiyonları ile mikroakışkan çip teknolojisinin birleştirilebileceğini, üç boyutlu yazıcıların bu mikroakışkan çiplerin üretimi sırasında kullanılabileceğini bize göstermiştir.
Keywords : LAMP, Salmonella, Mikroakışkan, 3B