Programming Of Energy Metabolism In Prostate Carcinoma: In Silico Analysis

Authors : Mustafa Emre ERCIN, Ender ŞİMŞEK

Pages : 350-356

Doi:10.37989/gumussagbil.797335

View : 19 | Download : 7

Publication Date : 2021-01-02

Article Type : Research Paper

Abstract :Prostat karsinomunun, dikkate değer bir onkojenik modüle edilmiş metabolik programlama sergileyen, hipoksik ve lipojenik bir solid tümör olduğu bilinmektedir. Glukoz alımının ve Warburg etkisi olarak bilinen aerobik glikolizin artması hipoksik tümörlerin ana metabolik değişiklikleridir. Protein, nükleik asit ve lipid biyosentezi, kanserin metabolik yeniden programlanması ile ilişkili diğer metabolik süreçlerdir. Prostat karsinomunda “Warburg” etkisine ek olarak, alternatif metabolik yolaklarda yağ asitleri, glutamin ve mitokondriyal oksidatif fosforilasyon tümörün progresyonunda önemli katılımcılar olarak kabul edilir. Bu çalışmanın amacı, az diferansiye (seminal vezikül invazyonlu) ve iyi diferansiye prostat karsinomlarında enerji metabolizmasının programlanmasını araştırmaktır. GSE32448 mikrodizi verileri “Gene Expression OmniBus" tan indirildi. Gen ekspresyon seviyesindeki farklılıklar, 40 prostat kanseri örneğinden elde edilen dokuların mRNA transkriptlerinin yeniden analiz edilmesiyle üretildi. R programı kullanılarak biyoenformatik analiz ile "Biobase", "Limma" ve "Geoquery" kütüphaneleri elde edildi. Yağ asidi metabolizması ile ilgili genlerde istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar bulunmuştur. Prostat kanserinde lipid metabolizmasının rolüne ilişkin artan farkındalık, bu maligniteye karşı daha iyi tedavi stratejilerinin geliştirilmesine yol açabilir.
Keywords : Biyoinformatik, Metabolik yeniden programlama, Moleküler Patoloji, Prostat Kanseri