Çukurova ve Şanlıurfa bölgelerinde deri lezyonlarından izole edilen leishmania sp. DNA’larının restriksiyon endonükleazlarla karşılaştırılması

Authors : Fuat DİLMEÇ, Ali MATUR, Soner UZUN, Mehmet KARAKAŞ, Hamdi R MEMİŞOĞLU

Pages : 21-27

View : 48 | Download : 10

Publication Date : 2004-08-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Leishmaniasis, dünyanın tropikal ve subtropikal bölgelerinde yaygın olarak görülmektedir. Leishmania türlerinin tiplendirilmesinde, günümüzde klasik mikroskobik teknikler yanında DNA’ya dayalı teknikler kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Çukurova ve Şanlıurfa bölgeleri deri lezyonlarından izole edilen Leishmania suşları arasında genotipik farklılıkların olup olmadığını saptamak amaçlanmıştır. Gereç-Yöntem: Hastaların deri lezyonu kenarlarından iğne aspirasyonu ile alınan örnekler NNN besiyerine ekilerek promastigotlar elde edilmiştir. Büyük hacimde promastigot kültürü yapıldıktan sonra promastigotlardan DNA izole edilmiş ve DNA; Eco RI, Hind III, Hae III, Hinf I, Alu I ve Rsa I restriksiyon endonükleazları ile kesilmiş ve agaroz jelinde elde edilen DNA profilleri karşılaştırılmıştır. Bulgular: 18’i Çukurova, 7’si Şanlıurfa bölgelerinden elde edilen suşlardan ve 14 referans suştan izole edilen toplam 39 DNA örneği RFLP Restriction fragment lengt polymorphisms analizi ile karşılaştırılmış ve Çukurova bölgesinden izole edilen deri Leishmania örneklerinin, Şanlıurfa bölgesi Leishmania örneklerinden daha heterojen oldukları belirlenmiştir. Sonuç: Her iki bölgeden izole edilen cutaneous leishmaniasis etkenleri arasında genotipik farklılıklar tespit edilmiştir. Tiplendirme için, PCR Polymerase Chain Reaction tekniğinin uygulanması şarttır
Keywords : Jel elektroforezi, Restriksiyon endonükleaz, RFLP analizi, DNA, total DNA İzolasyonu

ORIGINAL ARTICLE URL