Association of BRCA1 (G22231T, T25025A, C28300A) polymorphisms with subclinical mastitis and milk yields in Holstein Cattle

Authors : Fadime DALDABAN, Korhan ARSLAN, Aytaç AKÇAY, Md Mahmodul Hasan SOHEL, Bilal AKYÜZ

Pages : 12-19

Doi:10.31196/huvfd.806050

View : 39 | Download : 11

Publication Date : 2021-06-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmanın amacı Holstein ırkı sığırlarda BRCA1 geninde meydana gelen üç farklı tek nokta mutasyonun, subklinik mastitis ve süt verimi arasındaki ilişkinin araştırılmasıdır. Bu amaçla hayvan materyali olarak aynı bakım ve beslenme koşullarına sahip 151 dişi Holstein ırkı sığır seçildi ve bu sığırların dört laktasyon dönemi boyunca verim kayıtları kullanıldı. Total DNA, kan örneklerinden fenol:kloroform:izoamil alkol yöntemiyle izole edildi. Elde edilen DNA örneklerinden BRCA1 genindeki G22231T, T25025A ve C28300A tek nokta mutasyonları için PCR-RFLP yöntemi ile genotipleme yapıldı. Hayvanlarda subklinik mastitisinin bulunup bulunmadığı, süt örneklerine yapılan California Mastitis Testi (CMT) ile belirlendi. Çalışmada CMT verileri, dört laktasyon dönemi süt verim bilgileri ve tek nokta mutasyonları sonucu ortaya çıkan genotiplerinin orantılı olarak dağılımları hesaplanmıştır. Verilerin istatistiksel anlamlılığı Pearson ki-kare testi ile yapılmıştır. İncelenen örneklerde monomorfik olan C28300A tek nokta mutasyonunun subklinik mastitis ile bir ilişkisi analiz edilmemiştir. G22231T, T25025A tek nokta mutasyonlarından sonra oluşan genotiplerin ise orantılı dağılımı arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır (P>0.05). Yapılan Ki-kare (χ2) analizi sonucunda Holstein ırkı sığırların G22231T ve T25025A tek nokta mutasyonları açısından Hardy-Weinberg dengesinde olduğu görülmüştür. BRCA1 geninin görev aldığı fizyolojik süreçler göz önüne alındığında mastitise direnç ile ilgili çalışmalarda bu gen ve SNP’lerin daha çok örnekle değerlendirilmesi gerektiği düşünülmüştür.
Keywords : BRCA1 gene, Holstein, Mastitis, PCR RFLP

ORIGINAL ARTICLE URL