Genetic Diversity and Bottleneck Analysis of Endangered Güney Karaman Sheep

Authors : Necdet AKAY, Tülay CANATAN, Onur YILMAZ, Nezih ATA, Orhan KARACA, İbrahim CEMAL

Pages : 143-154

View : 25 | Download : 18

Publication Date : 2020-12-27

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışma, FAO tarafından önerilen onaltı mikrosatellit belirteç kullanılarak genetik kaynak olarak korunan Güney Karaman koyun popülasyonuna yönelik genetik çeşitlilik ve darboğaz analizlerinin gerçekleştirilmesi amacıyla gerçekleştirilmiştir. Çalışmanın hayvan materyalini Bahri Dağdaş Uluslararası Tarımsal Araştırma Enstitüsü'nde yetiştirilen 119 Güney Karaman ırkı koyun oluşturmuştur. Çalışılan on altı mikrosatellit belirteçten toplam 277 allel tespit edilmiştir. Populasyon büyüklüğü çok sınırlı olmasına rağmen, ortalama alel sayısı (17.31), gözlemlenen heterozigotluk (0.81) ve polimorfik bilgi içeriği (0.82) bulguları, bu popülasyonda gözle görülür bir genetik çeşitlilik olduğuna işaret etmektedir. İncelenen on altı mikrosatellit belirteçin onunda pozitif FIS değeri elde edilmiştir. Ortalama FIS değeri 0.042 olmuştur. Genetik darboğazın tespiti için Bottleneck yazılımındaki sonsuz alel modeli (IAM), iki fazlı mutasyon modeli (TPM) ve aşamalı mutasyon modeli (SMM) gibi üç farklı model kullanılmıştır. Gerçekleştirilen darboğaz analizinden elde edilen L şeklindeki eğri, Güney Karaman koyun populasyonunda yakın zamanda herhangi bir genetik darboğaz olmadığını ortaya çıkarmıştır. Bu sonuçlar, Güney Karaman koyun populasyonu için koruma stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olacaktır.
Keywords : Genetik Çeşitlilik, Genetik Kaynak, Mikrosatellit, Populasyon yapısı