Phylogenetic Analysis of Abaza, Kaçkar, Georgian (Caucasian), Ovit Region (İspir) Native Goat Breeds Using mtDNA D-loop Sequences

Authors : Sadrettin YÜKSEL, Mehmet Ali YILDIZ, Fatma YÜKSEL, Erdoğan SEZGİN

Pages : 176-188

View : 18 | Download : 10

Publication Date : 2020-12-27

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu araştırmanın amacı, Abaza, Kaçkar, Gürcü (Kafkas) ve Ovit Bölgesi (İspir) keçi ırklarında mtDNA D-Loop bölgesinin genetik çeşitliliğini ve birbirleriyle olan filogenetik ilişkilerini belirlemektir. Türkiye'nin bazı bölgelerinde birçok nedenden dolayı keçi sayısı giderek azalmış, böylece keçiler hakkında bilimsel olmayan hipotezler üretilmeye başlanmıştır. Bu doğrultuda, Türkiye'nin Doğu ve Kuzeydoğu bölgelerinde yetiştirilen yerli keçi ırklarının kökeni ve gen akışının, DNA temelli yöntemler kullanılarak ortaya konması önemli bilgilerin elde dilmesine yardımcı olacaktır. Bu çalışmada, dört yerli ırktan 200 baş keçi mtDNA D-loop dizileri için örneklenmiştir. Haplotip ve nükleotid çeşitliliği sırasıyla 0.974 ve 0.019 olarak tahmin edilmiştir. Yerli keçi popülasyonlarında 63 polimorfik bölgeden toplam 52 haplotip gözlenmiştir. İncelenen popülasyonlarda sadece bir A haplogrubu bulunmuştur. Tüm sekansların katılımıyla, neighbor-joining tree (NJT) oluşturulmuştur. En düşük genetik uzaklıklar (0,011), Kaçkar ve Ovit Bölgesi (İspir) arasında gözlemlenmiştir.
Keywords : Abaza Keçisi, Kaçkar Keçisi, Ovit Bölgesi Keçisi İspir, Haplotip, Mitokondrial D Loop