Bazı Sebze ve Meyvelerde Yumuşak Çürüklük Oluşturan Pektolitik Bakterilerin Tanı ve Karakterizasyonu

Authors : Fatih DADAŞOĞLU, Recep KOTAN

Pages : 155-161

View : 42 | Download : 6

Publication Date : 2017-03-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada meyve ve sebzelerde yumuşak çürüklük hastalığına sebep olan Pectobacterium caratovorum subsp. atrosepticum ve Erwinia chrysanthemi türlerinin klasik ve moleküler yöntemler kullanılarak kesin tanısının yapılması hedeflenmiştir. Bu amaçla farklı meyve ve sebzelerde yumuşak çürüklük etmeni olduğu tespit edilen izolatlar ilk olarak mikrobiyal tanı sistemi (MIS) kullanılarak tanılanmış ve 7 farklı P. c. subsp. atrosepticum izolatı ile 5 farklı E. chrysanthemi izolatı elde edilmiştir. Ayrıca, strainler yine BIOLOG sistemi kullanılarak da tanılanmış olup elde edilen sonuçların MIS sisteminde alınan sonuçlardan farklı olduğu gözlemlenmiştir. Yapılan hypersensitive reaction (HR), patojenite ve pektolitik aktivite testleri sonucu bu strainlerin tamamının patojen olduğu belirlenmiştir. Patojen olduğu belirlenen strainlerin kesin tanı ve karakterizasyonu için çeşitli biyokimyasal ve moleküler testler (16S rDNA PCR ve spesifk PCR) yapılmıştır. 16S rDNA PCR testleri sonucunda strainlerin cins düzeyinde tanısı yapılmış olup, izolatların tamamının yaklaşık 1500 bp uzunluğunda bant verdiği tespit edilmiştir. Patojen olduğu belirlenen ve tanılanan P. carotovorum subsp. atrosepticum izolatlarının çilek, dut, maydanoz, lahana, patates, biber ve patlıcanda, E. chrysanthemi izolatlarının ise; 2 tanesinin soğanda, 2 tanesinin biberde ve 1 tanesinin de maydanozda yumuşak çürüklük hastalığına neden olduğu belirlenmiştir.
Keywords : MIS, Moleküler tanı, Pectobacterium, Yumuşak çürüklük

ORIGINAL ARTICLE URL