Kolorektal kanserde lncRNA DPP10-AS1 ekspresyonu tümör baskılayıcı ve tümör mikroçevresinde metabolit transportuyla ilişkili olabilir mi?

Authors : Gülper NACARKAHYA, Cem HOROZOĞLU

Pages : 162-168

Doi:10.17941/agd.974118

View : 17 | Download : 12

Publication Date : 2022-01-11

Article Type : Research Paper

Abstract :Giriş ve amaç: Onkogen ve tümör baskılayıcı gen ifadeleri başta olmak üzere birçok RNA ve proteinle moleküler etkileşimde bulunabilen lncRNA’lar solid organ kanserlerinde ilişkilendirilmeye başlanmıştır. Deneysel çalışmalarda Wnt/β -katenin yolağı ile ilişkilendirilen lncRNA DPP10-AS1’in çalışmamızda kolorektal tümörlerdeki ifadesi ve serum biyobelirteçleriyle olan ilişkisinin incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve yöntem: Kolorektal kanser tanılı elli bir olgunun tümör ve tümörsüz çevre dokusuna ait formalinle fikse edilmiş parafine emdirilmiş bloklarından total RNA izolasyonu gerçekleştirildi. İzole edilen total RNA’dan lncRNA’lara spesifik c-DNA sentezi gerçekleştirildikten sonra DPP10-AS1’e özgü primerler ile gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile ekspresyon düzeyi tespit edildi. Ekspresyon düzeyleri olguların serum biyomarkerlarıyla korelasyon yönünden incelendi. Bulgular: lncRNA DPP10-AS1 ‘in katlı değişimi tümörsüz çevre dokusunda tümör dokusuna göre yaklaşık 5,7 kat yüksek olduğu tespit edilmiştir (P=0,0002). Histopatolojik bulgularla lncRNA DPP10-AS1 arasında istatistiksel bir farklılık tespit edilmezken, uzak organ metastazı olmayanlarda olanlara göre 1,5 kat yüksek olduğu izlenmiştir (p>0.05). DPP10-AS1 ile albümin (r: ,403; p=0,033) ve amilaz (r: ,450; p= 0,031) arasında pozitif korelasyonları tespit edildi. Sonuç: DPP10-AS1’in tümör baskılayıcı rolü olduğunu, albüminle korelasyonu tümör mikroçevresinde sekonder metabolitlerin transportunda rol oynayabileceğini düşündürmektedir. DPP10-AS1 ile amilaz korelasyonunun literatürde tanımlanan yüksek amilaz düzeylerinin tümör farklılaşması, çoğalması sürecindeki etkisiyle paralele şekilde tümör mikroçevresinin bir yanıtı olarak ifade edilebileceğini düşünmekteyiz.
Keywords : lncRNA, DPP10 AS1, Amilaz, Albümin, Kolorektal kanser