Non-albicans Candida Türlerinin Moleküler Tiplendirilmesi ve Antifungal Duyarlılıklarının Belirlenmesi

Authors : Hulusi Güven, Filiz Orak, Adem Doğaner, Kezban Tülay Yalçınkaya, İbrahim Seyfettin Çelik

Pages : 65-74

Doi:10.17517/ksutfd.1266358

View : 57 | Download : 72

Publication Date : 2024-07-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Son yıllarda invazif kandidiyaz enfeksiyonlarında albicans -dışı Candida türleri lehine bir artış olmuş ve antifungal ilaçlara dirençli suşların ortaya çıkması ile birlikte tedaviye uygun antifungallerin seçimi daha da önem kazanmıştır. Bu çalışmada albicans dışı Candida türlerinin tanımlanmasında DNA dizi analizi sonuçlarının Phoenix Yeast ID Panel (BD, ABD) ticari tanımlama sistemi ile karşılaştırılması ve izolatların antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya, Ekim 2019-Ekim 2021 tarihleri arasında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 82 albicans dışı Candida türü dahil edildi. İzolatları tanımlamak için geleneksel yöntemlerle birlikte BD Phoenix Yeast ID (BD, ABD) otomatik tanımlama sistemi ve DNA dizi analizi kullanıldı. İzolatların amfoterisin B, itrakonazol, flukonazol ve vorikonazol için duyarlılıkları EUCAST tarafından önerilen sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile çalışıldı. Bulgular: BD Phoenix™ Yeast ID Panel otomatize sistem ile izolatların 26 (% 31,7%)’sı C. tropicalis, 25 (% 30,5%)’i C. parapsilosis complex, 17 (% 20,7)’si C. glabrata, 4 (% 4,9)’ü C. kefyr, 4 (4.9%)’ü C. firmetaria, 3 (% 3,7)’ü C. krusei, 2 (% 2,4)’si C. norvegensis ve 1 (% 1,2)’i C. lambica olarak tanımlandı. BD Phoenix™ Yeast ID Panel otomatize sistem moleküler yöntem ile karşılaştırıldığında; 82 türden 62 (% 75,61)’sinin doğru tanımlandığı saptandı (p<0,001, κ =0,655). Uyumlu tanımlama bulgularına göre en sık izole edilen türler C. tropicalis (n= 24, % 80), C. parapsilosis kompleks (n= 22, % 88) ve C. glabrata kompleks (n= 11, % 57,9) bulundu. Uyum oranı, sık izole edilen türler için (C. tropicalis, C. parapsilosis kompleks ve C. glabrata kompleks) % 77, seyrek izole edilen türler için (C. kefyr ve C. krusei) ise %50 olarak belirlendi (p= 0.194; x2=2.768). Antifungal duyarlılık testine göre; izolatların 6 (% 7,3)’sı amfoterisin B’ye, 22 (% 26,8)’si flukonazole, 16 (% 19,5)’sı itrakonazole ve 9 (% 10,9)’u vorikonazole dirençli bulundu. Sonuç: Moleküler testlerin yapılamadığı laboratuvarlarda fenotipik testler Candida türlerinin tanımlanmasında tek başına yeterli olmayıp, lam kültürü gibi morfolojiyi belirlemeye yönelik testlerle birlikte değerlendirilmelidir.
Keywords : Non albicans Candida, DNA dizi analizi, Antifungal, Duyarlılık testi