Molecular Docking Analysis of Some Bioactive Molecules of Cistus incanus Against SARS CoV-2

Authors : Sakine Kübra ÇELİK, Elvan ÜSTÜN

Pages : 522-532

Doi:10.31466/kfbd.939421

View : 21 | Download : 7

Publication Date : 2021-12-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Koronavirüs hastalığı, halen yaşanmakta olan pandemik süreçle bütün dünyayı etkilemektedir. Hastalık ile mücadele tüm dünyada, aşılama çalışmaları ile devam etmektedir. Koruyuculuk süresi ve aşıya ulaşmadaki zorluklar düşünüldüğünde, hastalık ile mücadelede başarılı olunabilmesi için, virüsün öldürülmesi ya da replikayonunun engellenmesini sağlayan ilaçlara ihtiyaç vardır. İlaç çalışmalarında fitokimyasalların virüs üzerine etkisinin incelenmesinin ardından, daha etkili moleküllerin sentezlenebilmesi için izole moleküllerin modifiye edilmesi yöntemi uygulanır. İzole edilen her bir molekülün anti-viral aktivitesinin in-vitro yöntemlerle analizi mümkün değildir ve bu sorunun üstesinden gelmek için in-silico yöntemler yardımcı olabilir. Cistus incanus daha önce pek çok virüsün denemeleri yapılarak anti-viral aktivitesi teyit edilmiş bir bitkidir. Bu çalışmada içerik analizi sonrasında Cistus incanus’da tespit edilen myricetin 3-O-hexoside, myricitrin, quercitrin ve kaempferol 3-O-rutinocide moleküllerinin papain-like protease and main protease ile etkileşimi moleküler doking yöntemleri ile analiz edilmiştir. Analizlerin sonucunda incelenen moleküller ile papain-like protease ve main protease arasında güçlü H-bağları tespit edilmiştir.
Keywords : COVID 19, Papain Like Proteaz, Cistus incanus, Moleküler Doking