MESANE TÜMÖRLÜ HASTALARIN KANLARINDA EPİGENETİK BİYOBELİRTEÇLER OLARAK PROTOKADERİN GEN AİLESİ ÜYELERİ PCDH8, PCDH10 VE PCDH17’NİN ARAŞTIRILMASI

Authors : Zeynep YEĞİN, Filiz ÖZEN, Haydar KOÇ, Asıf YILDIRIM, Recep BÜYÜKALPELLİ

Pages : 163-171

Doi:10.24938/kutfd.676670

View : 16 | Download : 11

Publication Date : 2020-08-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Çalışmanın amacı mesane tümörlü hastalarda ve sağlıklı kontrollerde protokaderin gen ailesine ait olan protokaderin 8 (PCDH8), protokaderin 10 (PCDH10) ve protokaderin 17 (PCDH17) genlerinin periferal kan DNA metilasyon profillerini analiz ederek bu profillerin tümör-spesifik olası etkilerini değerlendirmektir. Araştırılan üç genin metilasyon profiliyle spesifik demografik ve/veya klinikopatolojik veriler arasındaki olası ilişkinin araştırılması da çalışmanın ikinci hedefidir. Gereç ve Yöntemler: Mesane karsinomalı (n=80; düşük dereceli: 40, yüksek dereceli: 40) ve sağlıklı kontrollerin (n=40) periferal kan örneklerinden ekstrakte edilen genomik DNA promotor bölgelerinin hipermetilasyon analizi için bisülfit modifikasyon ve metilasyon-spesifik PCR işlemine maruz bırakılmıştır. Bulgular: PCDH8 metilasyon profilinin yaşla birlikte artış gösterdiği gözlenmiştir. Neredeyse kontrollerin tamamında da bu genler bakımından kısmi metilasyon profilleri belirlendiği için hasta örneklerindeki PCDH10 ve PCDH17 metilasyon paternleri bir farklılık oluşturmamakla beraber PCDH8 daha farklı bir kan epigenetik profili sergilemiştir. Sonuç: PCDH8 geninin kandaki metilasyon modelinin yaşlanma süreciyle ilişkisi çalışmamızda gösterilmiştir. Mesane kanserindeki etkisi açısından daha kesin bir sonuca varabilmek için PCDH8’in kandaki metilasyon durumunun daha yüksek sayılı kohortta ve MethyLight gibi daha duyarlı metotlarla araştırılmasını tavsiye etmekteyiz.
Keywords : Mesane kanseri, DNA metilasyonu, periferik kan, PCDH8, PCDH10, PCDH17