Linkage Disequilibrium (LD) Analysis in Alfalfa (Medicago sativa L.) Populations Spreading in Different Geographies of the World

Authors : Doğan İLHAN

Pages : 846-853

Doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.452852

View : 18 | Download : 10

Publication Date : 2018-11-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Kültür yoncası ( Medicago sativa L.), ıslah çalışmaları sonucunda Medicago sativa tür kompleksinden geliştirilmiştir. Son zamanlarda, yonca bitkisindeki çalışmaların moleküler markörler temelinde DNA polimorfizmlerini belirlemeye ve bu polimorfizmlerle ilişkili olan fenotipler arasında bağlantı kurmaya odaklandığı bilinmektedir. Özellikle genotipler ve fenotipler arasındaki ilişkiler, Bağlantı Analizleri ve İlişki Haritalama çalışmaları şeklinde değerlendirilmektedir. Bilgiler temelinde bu çalışmada; 70 populasyon için 31 SSR markörü kullanılarak Bağlantı Eşitsizliği (Linkage Disequilibrium, LD) analizi de gerçekleştirilmiştir. Bağlantı Eşitsizliği analizi için; 31 markörden 23 tanesinin yonca’nın 8 kromozomu üzerindeki fiziksel mesafeleri belirlenmiştir. 8 kromozom üzerinde 103 lokustan oluşan mesafeler Medicago truncatula genomu temel alınarak saptanmıştır. Değerlendirilen markörler için; bu populasyonlarda önemli (p<0,0001) bir Bağlantı Eşitsizliği (LD) değeri gözlenmemiştir.
Keywords : Medicago sativa tür kompleksi, fiziksel mesafeler, SSR markörler, kromozom