Assessment of Genetic Diversity in Cucumber (Cucumis sativus L.) Genotypes Using Morphological Characters and AFLP Analysis

Authors : Yaşar KARAKURT, Damla GÜVERCİN, Sercan ÖNDER, Özgür İŞLER

Pages : 577-585

Doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.583844

View : 44 | Download : 11

Publication Date : 2020-06-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmanın amacı hıyar genotiplerinin morfolojik ve moleküler çeşitliliğini değerlendirmektir. Bu amaçla, altı adet morfolojik özellik (bitki morfolojisi, bitki boyu, yaprak ayası büyüklüğü, meyve uzunluğu, meyve çapı ve meyve sapı uzunluğu) ve sekiz AFLP markeri kullanılarak 18 hıyar hattı genetik çeşitlilik açısından değerlendirilmiştir. Kullanılan AFLP primer kombinasyonları polimorfizm göstermiştir. Çalışma sonucunda 1975 AFLP fragmanı elde edilmiş ve 1468 fragmanın polimorfik olduğu görülmüştür (%75.34). Dendrogramlar, aritmetik ortalamalar kullanılarak UPGMA (Unweighted Pair Group Method) yöntemiyle çizilmiş ve UPGMA dendrogramına göre hıyar genotipleri iki ana gruba ayrılmıştır. Dendrogramın genetik mesafeleri 0.92 ile 0.96 arasında değişmiştir. Morfolojik verilere dayanan küme analizinde ise UPGMA dendrogramı tüm hatları üç ana kümeye ayırmıştır. Çalışmada kullanılan hıyar hatlarının benzerlik katsayısının 0.888 ile 0.982 arasında değişen düşük bir genetik varyasyon seviyesine sahip olduğu belirlenmiştir. 8 çift AFLP primeri ile oluşturulan filogenetik dendogramlarla, morfolojik taksonomi ile yapılan UPGMA kümeleme analizleriyle oluşturulan dendogramlar örtüşmektedir.
Keywords : AFLP, Hıyar, Genetik uzaklık, Akrabalık

ORIGINAL ARTICLE URL