Characterization of Diaporthe ampelina isolates and their Sensitivity to Hot-Water Treatments and Fungicides in in vitro

Authors : Davut Soner AKGÜL, Qamar Nawaz AWAN

Pages : 1378-1389

Doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.1020144

View : 17 | Download : 12

Publication Date : 2022-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Diaporthe ampelina (=Phomopsis viticola) dünyadaki üzüm yetiştirilen ülkelerde hem sürgün/yaprak lekesi hem de odun kangrenine neden olan en önemli patojenlerden biridir. Bu araştırmada, 23 D. ampelina izolatının morfolojik, moleküler ve patojenik karakterizasyonu çalışılmış ve bunların bağcılıkta kullanılan bazı fungisitlere ve sıcak su uygulamalarına karşı duyarlılığı test edilmiştir. Morfolojik olarak izolatlar, “W” tipi ya da “G” tipi koloni görünümleri ve mikroskobik özelliklerine göre gruplandırılmıştır. Moleküler karakterizasyonda beta-tubulin, calmodulin ve translation elongation factor (tef1-α) gen bölgeleri PCR ile çoğaltılmıştır. Nükleotid dizileri NCBI-BLAST yazılımı kullanarak analiz edilmiş, gen bankasına kaydedilmiş ve tür tanısı doğrulanmıştır. Miseliyal canlılık sıcak su uygulamalarına karşı (46–50°C’de 30-45 dk.) santrifüj tüplerinde test edilmiş ve termal inaktivasyon noktası saptanmıştır. Bu aynı zamanda in vitro’da bazı fungisitlere karşı (azoxystrobin, boscalid, cyprodinil, tebuconazole, azoxystrobin + cyproconazole + tebuconazole, cyprodinil + fludioxonil, azoxystrobin + tebuconazole and fludioxonil) test edilmiş ve EC50 değerleri hesaplanmıştır. Morfolojik ve moleküler çalışma sonuçları tüm izolatların D. ampelina olduğunu ve bunların asma odunsu dokularında patojen olduklarını göstermiştir. “W” tipi izolatların termal inaktivasyonu 48°C-30 dakikalık sıcak su uygulamasıyla sağlanmıştır. Bu uygulama “G” tipi izolatların koloni büyümesini azaltmasına rağmen tamamen inhibe etmemiş, tam eradikasyona ulaşmak için 48°C-45 dakikalık uygulamaya gerek duyulmuştur. Fungisit duyarlılığı ele alındığında, fludioxonil ve tebuconazole içeren fungisitler fungusun miseliyal büyümesini baskılamada en etkili olmuşlardır. Ancak azoxystrobin, boscalid ve cyprodinil, fludioxonil ve tebuconazole ile kıyaslandığında güçlü bir inhibisyon sergileyememiştir.
Keywords : Asma, Diaporthe ampelina, Fludioxonil, Sıcak su, Tebuconazole