Tarımsal Topraklardan İzole Edilen Bazı Hypocreales Üyelerinin Moleküler Teşhisi ve Filogenisi

Authors : Rasime DEMİREL

Pages : 137-142

View : 17 | Download : 14

Publication Date : 2017-10-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Hypocreanlean mantarları Dünya’daki önemli bitki patojenleridir. Bu türlerin sebep olduğu baş tahribat ve tahıl hasar hastalığı, tohum kalitesinde azalma ve tahılın mikotoksinler ile bulaşması nedeniyle büyük ekonomik kayıplardan sorumludur. Morfolojik ve biyokimyasal testler hala temel olsa da, bu mantarların moleküler teşhisine yönelim giderek artmaktadır. Bu makale, Eskişehir’deki tarım topraklarından izole edilmiş olan Hypocreanlean mantarlarının PCR ile identifikasyonunu incelemektedir. Bionectria, Fusarium, Gibberella ve Nectria olmak üzere 4 farklı cinse ait 5 Hypocreanlean mantarı 56 farklı toprak numunesinden izole edilmiştir. Bu suşların DNA`sı, cam boncuklar ve vorteks ekstraksiyon yöntemi ile izole edilmiş ve üniversal fungal spesifik primerler ile PCR amplifikasyonu için kullanılmıştır. Fungal ribozomal DNA`nın insert ignore into journalissuearticles values(rDNA); iç transkripsiyonlu ayırıcı insert ignore into journalissuearticles values(ITS); bölgeleri, CEQ 8000 Genetik Analiz Sistemi ile dizilenmiştir. Bu çalışmada elde edilen ITS-5.8S dizileri, GenBank veri tabanında depolanan dizilerle karşılaştırılmıştır. İncelenen birbirine yakın akraba Hypocreanlean mantarlarının filogenetik konumu belirlenmiştir.
Keywords : Hypocreanlean, PCR, ITS, Filogeni, Eskişehir