Saleplerden (Orkide) İzole Edilen Endofitik Fusarium spp.’nin Moleküler Tanımlanması ve Filogenetik Çeşitlilik Analizleri

Authors : Yüksel GEZGİN

Pages : 163-171

Doi:10.30708/mantar.956602

View : 19 | Download : 12

Publication Date : 2021-10-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Türkiyenin endemik bitkisi Salep insert ignore into journalissuearticles values(orkide); kök ve yumrulardan izole edilmiş endofitik fungus türlerinin moleküler teknikler kullanılarak tanımlanması son derece önemlidir. Bu çalışmada Salep insert ignore into journalissuearticles values(Orchid); bitkisinden izole edilen endofitik Fusarium Link türlerinin tanımlanması amaçlanmıştır. Bu amaçla beta-tubulin insert ignore into journalissuearticles values(β-tubulin: benA);, Internal Transcribed Spacer insert ignore into journalissuearticles values(ITS); ve Translation Elongation Factor insert ignore into journalissuearticles values(EF); gen bölgeleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PZR); ile özel primerler kullanılarak çoğaltılmıştır. Daha sonra tüm PZR ürünlerinin dizi analizi yapılmış ve GenBank’daki diğer ilgili diziler ile karşılaştırılmıştır. Fusarium izolatları tür düzeyinde Fusarium redolens Wollenw. insert ignore into journalissuearticles values(n=7); ve Fusarium oxysporum Schlecht. insert ignore into journalissuearticles values(n=3); olarak tanımlanmışlardır. Filogenetik analizler the β-tubulin, ITS ve EF gen dizilerini temel alarak gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmada, ilk olarak üç farklı gen bölgesinin çoğaltılması içeren moleküler tanımlama yöntemleri kullanılarak Türkiye’deki saleplerden insert ignore into journalissuearticles values(orkidelerden); izole edilen endofitik Fusarium spp. izolatları tür düzeyinde tanımlanmıştır.
Keywords : Salep, Orkide, Endofitik fungus, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Fusarium redolens, Fusarium oxysporum