HLA Moleküllerinde Peptit Ligandlarının Kompleks Stabilitesine Olan Etkisinin Araştırılması

Authors : Asuman BUNSUZ, Onur SERÇİNOĞLU, Pemra ÖZBEK

Pages : 403-414

Doi:10.7240/marufbd.368789

View : 13 | Download : 6

Publication Date : 2018-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Hücre yüzey glikoproteinleri olan Temel Doku Uygunluk Kompleks insert ignore into journalissuearticles values(MHC); molekülleri yabancı antijenlere bağlanır ve onları uygun immün tanınma için antijen sunucu hücrelerin yüzeyindeki T lenfosit hücrelerine sunar. İlk olarak insanlarda lökosit hücrelerinde tanımlanmış oldukları için, aynı zamanda İnsan Lökosit Antijenleri insert ignore into journalissuearticles values(HLA); olarak da isimlendirilirler. Son zamanlarda peptit bazlı aşıların tasarlanması üzerine odaklanan çalışmalar, peptitin sitotoksik T hücre aracılı immün cevabı uyarma yeteneği olarak tanımlanan peptit immunojenite mekanizmasının anlaşılmasına olanak sağlamaktadır. Peptit immünojenisitesinin, peptit-HLA kompleksinin stabilitesi ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Bu çalışmada, AIFQSSMTK and QVPLRPMTYK peptitlerine bağlanan HLA-A*03:01 ve HLA-A*11:01 al ellerinin stabilitesinin temel moleküler mekanizmalarını ortaya çıkarmak için moleküler dinamik simülasyonları gerçekleştiril miştir ve ENCOM sunucusu kullanılarak peptit rezidüleri üzerinde gerçekleştirilen tek nokta mutasyonlarının protein termostabilitesine olan tahmini etkisi araştırılmıştır.
Keywords : MHC Molekülü, Stabilite, Moleküler Dinamik Simülasyonu, Mutasyon, ENCOM