Detection and characterization of phytoplasmas in some cucurbits (Cucurbitaceae) and bindweed (Convolvulaceae) in Hatay Province of Turkey

Authors : Hakan ÇARPAR, Gülşen SERTKAYA

Pages : 166-173

Doi:10.37908/mkutbd.1041286

View : 16 | Download : 15

Publication Date : 2022-04-08

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: 2019’da bir hastalık surveyinde, şüpheli kabak bitkilerinde yaprakların sararması, bodurluk, boğum aralarının kısalması, çoklu sürgün oluşumu, tepe sürgünlerinde çalı görünümü, çiçeklerin yeşillenmesi ve kısırlık, fillodi, küçük ve şekli bozulmuş yapraklar ve gövde yassılaşması gibi fitoplazmalara özgü simptomlar gözlenmiştir. Böylelikle, bu çalışma Hatay ili kabak bitkilerinde ve tarla sarmaşığında fitoplazma hastalıklarının araştırılması amacıyla yürütülmüştür. Yöntem ve Bulgular: Hatay ili kabak tarlalarından şüpheli toplam 4 kış kabağı insert ignore into journalissuearticles values( Cucurbita moschata );, 12 yaz kabağı insert ignore into journalissuearticles values( Cucurbita pepo ); ve 2 tarla sarmaşığı insert ignore into journalissuearticles values( Convolvulus arvensis ); örnekleri toplanmıştır. Bitkilerden bazıları insert ignore into journalissuearticles values(2 kış kabağı, 10 yaz kabağı ve 2 tarla sarmaşığı); fitoplazmalara özgü simptom sergilemiştir. Toplam nükleik asit izolasyonu, CTAB metoduna göre yapılmıştır. Direct ve Nested PCR çalışmalarında sırasıyla F1/R0 ve R16F2n/R2 evrensel primer çiftleri kullanılmıştır. Simptom sergileyen kabak bitkilerinde insert ignore into journalissuearticles values(12/12); ve tarla sarmaşığında insert ignore into journalissuearticles values(1/2); beklenen ~1.2 kb büyüklüğünde bant elde edilirken simptomsuz kabaklarda elde edilememiştir. Simptom gösteren örneklerden 4 tanesi NCBI Genbankası’na insert ignore into journalissuearticles values(MT163353, MT163393, MT163396 ve MT163469); yüklenmiştir. Genel Yorum: Sekans ve filogenetik analizlerin ardından, kabak izolatlarının “ Candidatus phytoplasma trifolii” insert ignore into journalissuearticles values(16SrVI);, tarla sarmaşığı izolatının ise “ Candidatus phytoplasma solani” insert ignore into journalissuearticles values(16SrXII); olduğunu göstermiştir. Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Türkiye`de kabakgillerde fitoplazma enfeksiyonlarının ve doğal konakçıların durumu hakkında bilgi eksikliği bulunmaktadır. Mevcut bilgilerimize göre, Türkiye’de 16SrVI grubunun bir üyesi olan Candidatus phytoplasma trifolii`nin kışlık kabaklardan bal kabağı insert ignore into journalissuearticles values( C. moschata ); ve yazlık kabaklardan sakız kabağı insert ignore into journalissuearticles values( C. pepo ); bitkilerinde enfeksiyon oluşturduğu ilk kez belirlenmiştir.
Keywords : Ca phytoplasma solani, Ca phytoplasma trifolii, Fitoplazma, Kabak, Türkiye