Pamukta Lif Uzamasıyla İlişkili Genlerin Polimorfizmi

Authors : Gülay ZULKADİR

Pages : 79-98

Doi:10.17100/nevbiltek.210892

View : 20 | Download : 17

Publication Date : 2014-07-07

Article Type : Other Papers

Abstract :Tekstil sanayinin önemli hammaddesi olan pamuk özellikle doğal lifleri için yetiştirilmektedir. Bu nedenle lif oluşumu ve olgunlaşma aşamaları birçok araştırmanın konusu olmuştur. Pamukta lif uzamasıyla ilgili genlerin, pamuk ıslah çalışmalarında sıkça kullanılan germplazm içerisinde dağılımlarını ve polimorfizm durumlarını incelemek amacıyla yapılan bu çalışmada farklı türlere ait toplam 247 adet genotip arasından liflerinin uzun, orta, kısa ve lifsizlik özellikleri dikkate alınarak seçilen 35 adet pamuk genotipi materyal olarak kullanılmıştır. Seçilen pamuk genotipleri, Gossypium barbadense L.insert ignore into journalissuearticles values(1-9);, Gossypium hirsutum L.insert ignore into journalissuearticles values(10-25); ve diğer diploid ve tetraploidler; Gossypium herbaceum L. insert ignore into journalissuearticles values(26);, G.laxum Phillipe insert ignore into journalissuearticles values(27);, G.yucatanense insert ignore into journalissuearticles values(28);, G.marie galante insert ignore into journalissuearticles values(29);, G.mustelinum Miers ex Watt insert ignore into journalissuearticles values(30);, G.darwinii Watt insert ignore into journalissuearticles values(31);, G.nelsonii Fryx. insert ignore into journalissuearticles values(32);, G.Stocksii Mast. ex Hook. insert ignore into journalissuearticles values(33);, G.areysianum Defl. Hutch. insert ignore into journalissuearticles values(34);, G.bickii Prokh insert ignore into journalissuearticles values(35); türlerinden seçilmiştir. Ayrıca, lifsiz insert ignore into journalissuearticles values(23);, PI 528429 insert ignore into journalissuearticles values(24); ve PI 528426 insert ignore into journalissuearticles values(25); genotipleri lifsiz özellikte olup, seçilen yabani genotipler A, D, AD, C, E ve G genomlarını kapsamaktadır. Lif uzamasında etkili olduğu düşünülen genler geniş bir literatür taraması yapılarak belirlenmiş ve bunların homolojilerine bakılarak 4 adet primer tasarlanmıştır. Bu primerlerin tamamı kullanılarak pamuk genotiplerinde amplifikasyon yapılmış ve bu sonuçlar doğrultusunda genotipler arasında önemli farklılık gösteren CesA genine odaklanılmıştır. Fenotipleme neticesinde, G.barbadense genotipleri uzun ve kaliteli lifler, G.hirsutum genotipleri ise orta kalite ve orta uzunlukta lif üretmiştir. Çalışmada, seçilen genotiplerde lif uzunluğunun ortalama değeri 25,25 mm olup, 0- 36 mm arasında değişmiştir. PI 528896 insert ignore into journalissuearticles values(1); genotipi 36 mm ile en uzun lif özelliğine sahiptir. Genotiplerin birçoğunun lif uzunluğu 22 - 33 mm arasında değişmiştir. Bununla birlikte, yaklaşık olarak 500-510 bp uzunluğundaki allellerin SNP taşıdığı ve 2 allelde bulunan bu SNP’lerin amino asit değişimine neden olduğu belirlenmiştir. Bu değişimlerin lif kalitesiyle ilişkili olabileceği ve daha detaylı çalışmaların yapılması gerektiği sonucuna varılmıştır. Anahtar Kelime: Lif Kalitesi, Lif Uzunluğu, Gen, Polimorfizm, GhCesA, Pamuk
Keywords : Lif Kalitesi, Lif Uzunluğu, Gen, Polimorfizm, GhCesA, Pamuk