Molecular Docking Analysis of Benzimidazolium Type Molecules with VEGFR-2 and TrxR Crystal Structures for Evaluating Anti-Cancer Activity

Authors : Elvan ÜSTÜN, Neslihan ŞAHİN

Pages : 36-44

View : 26 | Download : 10

Publication Date : 2021-06-30

Article Type : Research Paper

Abstract :N-heterosiklik karbenler biyoaktiviteleri dolayısıyla sıklıkla incelenen bir molekül ailesidir. Kanserin dünyada ölüme neden olan 2. hastalık olduğu için, N-heterosiklik karbenlerin anti-kanser aktivitesi de incelenen özellikler arasındadır. Bütün aday moleküllerin biyoaktivitesinin incelenmesinin zorlukları değerlendirildiğinde, in-siliko yöntemlerin öngörü elde etmek için kullanılması avantajlıdır. Teorik hesaplama yöntemleriyle, mevcut moleküllerin özellikleri incelenebildiği gibi daha uygun moleküllerin sentezlenmesi için önbilgiler elde edilebilir. Bu çalışmada daha önce karakterize edilmiş 1-insert ignore into journalissuearticles values(allil);-3-insert ignore into journalissuearticles values(2,4,6-trimetilbenzil);benzimidazolyum klorür insert ignore into journalissuearticles values(1); ve 1-insert ignore into journalissuearticles values(allil);-3-insert ignore into journalissuearticles values(2,3,4,5,6-pentametilbenzil);benzimidazolyum klorür insert ignore into journalissuearticles values(2); molekülleri DFT temelli hesap yöntemleri ile yapısal olarak incelenerek optimize edilmiştir. Optimize moleküllerin VEGFR-2 ve TrxR kristal yapıları ile etkileşimleri moleküler doking yöntemleri kullanılarak analiz edilmiştir.
Keywords : N Heterosiklik Karbenler, Anti kanser, Moleküler Doking, DFT