Elma İçkurdu Zararlısının Kontrolünde Alternatif Yeni Aday Moleküllerin Kenetlenme Metodu ile Belirlenmesi

Authors : Nurcan Ersan Şeker, Vildan Atalay

Pages : 260-267

Doi:10.19113/sdufenbed.1370729

View : 63 | Download : 16

Publication Date : 2024-08-23

Article Type : Research Paper

Abstract :Elma içkurdu (cydia pomonella) zararlısının yönetimi, meyve üretiminde ciddi kayıplara neden olan ve tarım sektörü için büyük bir sorun haline gelen bir konudur. Bu çalışmada elma içkurdu ile mücadelede in siliko yöntemiyle etkili ve doğal ilaç moleküllerin belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu çalışma kapsamında Protein Data Bank ve Dr. Duke veri tabanlarından faydalanarak hedef protein 3rvz kristal yapısı ve insektisit özelliği olan 97 adet bitki aktif molekülleri seçilmiştir. 97 adet bitki aktif moleküllerinden en iyi sonuç veren 42 molekül ve 5 adet ticari insektisit kullanılarak bir çalışma yapılmıştır. Seçilen moleküllerin konformer taramaları, geometri optimizasyonları, yapı-aktivite ilişkisi (SAR) analizleri Spartan14.V1.14 programıyla gerçekleştirilmiştir. Moleküller kenetlenme çalışmalarında Autodock Tools 1.5.6 ve Autodock Vina programları kullanılmış, ayrıca ligand-protein etkileşimini görselleştirmek için BIOVIA Discovery Studio Visualizer programı kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlar, bağlanma afiniteleri, lineer regresyon grafikleri ve aminoasit etkileşim haritaları kullanılarak değerlendirilmiştir. Yapılan çalışma sonucunda, iyi korelasyon sağlayan, biyopestisit olma potansiyeline sahip L-7, L-9, L-13, L-14, L-16, L-18, L-19 aday molekülleri öne çıkmaktadır. Bu moleküllerin in vivo deneysel olarak incelenmesi önerilmektedir.
Keywords : Elma içkurdu, İnseksitit, Moleküler Kenetlenme, Voltaj Kapılı Sodyum Kanalları

ORIGINAL ARTICLE URL