Identification and phylogenetic differences of newly isolated Streptomyces sp.

Authors : Şükrü ÖNALAN, Hamdullah SEÇKİN

Pages : 680-685

Doi:10.30910/turkjans.891337

View : 59 | Download : 8

Publication Date : 2021-07-26

Article Type : Research Paper

Abstract :Antimikrobiyal direnç ve antibiyotik kullanımı günümüzde küresel bir sağlık krizidir. Streptomyces, antimikrobiyallerin çoğunun kaynağıdır. Bu nedenle, Streptomyces türleri arasındaki benzerlikler ve farklılıklar büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Dicle bölgesinden tortudan izole edilen 3 farklı Streptomyces türünün izolasyonu ve tanımlanması yapılmıştır. Daha sonra 16S rRNA gen dizisi elde edildi ve türler arasındaki benzerlikler ve farklılıklar ortaya çıktı. Çalışma sonucunda bakteriler klorometrik farklılıklar içeriyordu, SEM görüntüsünde spor zinciri morfolojisine bakıldığında yumru bir yapı oluştu, 16S rRNA dizileri 1000bp`den uzun ve oluşturulan filogenetik ağaçta 1 izolat ile yakından benzerlik gösterdi. GenBank`tan elde edilen diziler insert ignore into journalissuearticles values(93 <);, diğer iki izolatın farklı olduğu insert ignore into journalissuearticles values(15 <); gözlendi. Bu sonuçlar doğrultusunda elde edilen 2 farklı Streptomyces izolatı, sonraki çalışmalarda antibiyotik üretimi ve farklı direnç koşulları açısından önemlidir.
Keywords : Real Time PCR, Sekans, 16S rRNA gene, Streptomyces

ORIGINAL ARTICLE URL