Farklı Metotlar Kullanılarak Elde Edilen Aynı Miktar Bakteriyel DNA’lar Arasındaki Konsantrasyon Farklılıklarının Belirlenmesi

Authors : Şükrü ÖNALAN, Sümeyye ADALI, Abuzer TAŞ

Pages : 322-327

Doi:10.35229/jaes.626493

View : 57 | Download : 8

Publication Date : 2019-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada kültüre alınmış olan  L. garvieae  izolatları aynı besiyeri insert ignore into journalissuearticles values(TSA); ve miktarı insert ignore into journalissuearticles values(20ml); ile aynı çevresel şartlarda insert ignore into journalissuearticles values(7,4 pH, 21 o C, 24 saat); inkübe edilmiştir.  İzolatların identifikasyonları Real-Time PCR ile 16S rRNA gen bölgesine spesifik primer assay ile teyit edilmiştir. 24 saatlik inkübasyon periyodunun ardından 10ml’lik TSB besiyerinde gelişen izolatlar 600 nm dalga boyunda 1.0 OD’ye eşitlenmiştir. Farklı gruplardan DNA izolasyonları; sıvı besiyerinde kaynatma, katı besiyerinde insert ignore into journalissuearticles values(Eşit OD); kaynatma, 2 farklı ticari kit kullanılarak manuel izolasyon ve otomatik izolasyon robotu olmak üzere toplam 5 farklı metotla gerçekleştirilmiştir. İzole edilen DNA’ların ve gerçekleştirilen Real-Time PCR işleminin ardından izolasyon robotu ile elde edilen sonuçlarda DNA kalitesinin en iyi olduğu, bunu takiben ticari kitler, sıvı besiyeri izolasyonu ve katı besiyeri izolasyonları olduğu görülmüştür. Real-Time PCR grafiğinde, çalışma grupları arasındaki tekerrürler içerisinde en büyük sapma sıvı besiyeri izolasyonu ve ticari kit izolasyonunda gözlenmiştir.
Keywords : DNA izolasyonu, spektrofotometrik ölçüm, Real Time PCR, balık hastalıkları, L garvieae

ORIGINAL ARTICLE URL