A Brief Reconnoitre about Effects of MMP9 on Aortic Dissection

Authors : Burcu SALMAN YAYLAZ, Melda SARIMAN, Ahmet EKMEKÇİ, Emel ERGÜL, Mahmut ULUGANYAN, Fulya COŞAN, Özgün Melike TOTUK GEDAR, Neslihan ABACI

Pages : 12-20

Doi:10.26650/experimed.2021.874159

View : 27 | Download : 7

Publication Date : 2021-05-03

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Kardiyovasküler hastalıklar ve kanser metastazında sıklıkla araştı-rılan matriks metalloproteinazlar insert ignore into journalissuearticles values(MMPs); ekstraselüler matriks düzenle-yicileridir. Çalışmamız, aort diseksiyonu olan hastalarda MMP9 genindeki spesifik polimorfizmleri incelemeyi ve MMP9`un aort diseksiyonu üzerin-deki etkisini ekspresyon veri setleri ile karşılaştırmayı amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntem: Q279R ve P574R polimorfizmleri 44 aort diseksiyon tanısı almış ve 40 sağlıklı bireyde polimeraz zincir reaksiyonu - restrik-siyon parça uzunluğu polimorfizmi insert ignore into journalissuearticles values(PCR-RFLP); yöntemiyle çalışıldı. Q279R ve P574R prevalansı istatistiksel olarak hastaların tıbbi verileriyle karşılaştırıldı. Buna ek olarak, NCBI GEO veri tabanından aort diseksiyon veri setleri toplandı ve MMP9 ifadesindeki farklılıkları görmek amacıyla bu veri setleri GEO2R ve RStudio ile yeniden analiz edildi. Elde edilen sonuçların informatik analizi için çevrimiçi veri tabanları kullanıldı. Bulgular: CG alleli taşıyıcısı kadınların aort diseksiyonu geliştirme riski erkeklerden daha yüksek bulunmasına rağmen her iki çalışma grubun-da da allellerin genotipik dağılımı benzer bulunmuştur. MMP9`un pro-tein-protein etkileşim analizinin ve hastaların tıbbi verilerinin incelen-mesinin sonucu olarak, P574R hipertansiyonu olan hastalarda önemli bir bulgu olarak değerlendirilmiştir. Array verisi analizinde ise MMP9 ifa-desinde kritik bir değişim gözlemlenmemiş olup, birçok örnekte TIMPifade seviyelerinde azalma tespit edilmiştir. Ayrıca MMP9’u hedefleyen miRNA ekspresyon seviyelerinin aort dokusu ve kanda düşük olduğu saptanmıştır. Sonuç: Q279R ve P574R, MMP9 protein yapısını doğrudan etkilemeyen iki polimorfizmdir. İncelenen polimorfizmler ve gerçekleştirilen meta-a-nalizler, MMP9`un fenotipi doğrudan etkilemediği, ancak istatistiksel sonuçlarda görüldüğü gibi aort diseksiyonu gelişimi için zemin hazır-ladığını göstermektedir.
Keywords : Aort diseksiyon, MMP9, Q279R, P574R, gen ifade verisi

ORIGINAL ARTICLE URL