MATHEMATICAL MODELING OF METABOLIC PATHWAYS

Authors : Mustafa Bayram, Burcu Özyurt Serim

Pages : 17-24

View : 28 | Download : 17

Publication Date : 2008-09-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Bir metabolik patway’in kinetik analizini yapmak için, onun kinetik analizini tanımlayan matematiksel modelini inşa etmek en önemli olaydır. Bir metabolik teoride, iX metabolitinin ix konsantrasyonundaki değişimin hızı, sistemde bulunan ve her biri iX metabolitinin stokiyometri katsayısına göre ağırlıklı tane reaksiyonun hızlarının toplamı olarak kabul edilir. ve x sırasıyla hız ve konsantrasyon vektörlerini göstermek üzere, bir sistemin kinetiğinin matematik modeli rv dNvdt=x olarak yazılır. Burada metabolitlere ait stokiyometri matrisi, stokiyometri matrisi genelde bir sisteme ait ’ nin ayrışmasına bağlı olan, korunum bağıntılarının çıkarılışında önemli rol oynar. Bu çalışmada, verilen bir metabolik patway için korunum bağıntılarının hepsini çıkarmak amacıyla MAPLE de bir bilgisayar programı geliştirdik. Bu program verilen bir metabolik patway’e ait korunum bağıntılarını hesaplar. Bu metabolik patway de Metabolite ve ara ürünlerde herhangi bir kısıtlama yoktur.
Keywords : Metabolik patway, Stokiyometri matrisi, Korunum bağıntıları

ORIGINAL ARTICLE URL