İnsanda Uzun Kodlanmayan RNA’ların Doku İfade Örüntüleri ve Varsayımsal İşlevlerinin Benzeşme Yayılması Algoritması ile İncelenmesi

Authors : Gökhan KARAKÜLAH

Pages : 249-257

View : 52 | Download : 9

Publication Date : 2017-06-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Kümeleme yöntemleri, yüksek hacimli gen ifadesi örüntülerinden biyolojik olarak anlamlı bilginin elde edilmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Benzeşme yayılması algoritması, veri noktaları arasından örnekler adı verilen küme merkezlerinin belirlendiği ve bunların etrafında kümelerin oluşturulduğu yeni bir yaklaşımdır. Bu çalışmada, hastalık, gelişim ve farklılaşma gibi farklı hücresel olaylarda düzenleyici transkriptler olan uzun kodlanmayan RNA’ların, benzeşme yayılması algoritması ile 16 farklı sağlıklı insan dokusundaki ifade örüntüleri incelendi. Bununla beraber uzun kodlanmayan RNAların varsayımsal işlevleri, kümeleme yaklaşımı ile bilgisayar tabanlı olarak tahminlendi ve kapsamlı bir ifade örüntüsü – işlev kataloğu hazırlandı
Keywords : Benzeşme yayılması algoritması, biyoenformatik, kümeleme, uzun kodlanmayan RNA

ORIGINAL ARTICLE URL