Türkiye’deki Biarum Cinsine Ait Türlerin Kloroplast Trnl/Trnf Igs (Intergenic Spacer) Dizilimlerine Dayalı Filogenetik Analizi

Authors : Cahit Çeçen, Arif Parmaksız, Hasan Akan

Pages : 76-82

View : 66 | Download : 65

Publication Date : 2025-07-21

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışma, Türkiye’de doğal olarak yayılış gösteren Biarum cinsine ait türlerin filogenetik analizini yapmak amacıyla gerçekleştirilmiştir. Biarum, Araceae familyasına ait, genellikle Akdeniz bölgesinde yayılış gösteren, rizomlu veya yumrulu bir bitki cinsidir. Türkiye’de bu cinse ait 12 takson bulunmakta olup, bunların 5’i endemiktir. Araştırmada, Biarum türlerinin filogenetik ilişkilerini belirlemek amacıyla kloroplast DNA trnL-trnF intergenik bölgesi (IGS) kullanılmıştır. 2020-2022 yılları arasında Türkiye’nin farklı bölgelerinden toplanan bitki örneklerinden DNA ekstraksiyonu yapılmış ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemiyle trnL-trnF bölgesi çoğaltılmıştır. Elde edilen DNA dizileri biyoinformatik programlar ile hizalanarak Neighbor-Joining (NJ) yöntemi ile filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Sonuçlara göre, Biarum cinsine ait türlerin büyük çoğunluğu monofiletik bir grup oluşturmaktadır. Bazı türlerin birbirine genetik olarak daha yakın olduğu belirlenmiştir. Bu türler arasında; Biarum x cinarense ve Biarum carduchorum türlerinin yakın akraba oldukları belirlenmiştir. Öte yandan, Biarum syriacum daha izole bir konumda yer almakta olup diğer türlerden daha farklı bir genetik yapıya sahiptir. Bu çalışma, Biarum cinsinin genetik çeşitliliğini ve filogenetik ilişkilerini daha iyi anlamamıza katkı sağlamıştır. Türkiye’de yayılış gösteren Biarum cinsi için yapılan ilk filogenetik çalışma olmasından dolayı burada elde edilen veriler, gelecekte yapılacak çalışmalar için bir kaynak teşkil edecektir.
Keywords : Biarum, filogenetik analiz, kloroplast DNA, Trnl/Trnf Igs

ORIGINAL ARTICLE URL