Presence of ‘Candidatus Phytoplasma trifolii’ in yellowing and bushy appearance-associated pepper plants from Iğdır Province of Turkey

Authors : Abdullah GÜLLER, Mustafa USTA, Gülüstan KORKMAZ, Serap DEMİREL, Zeynelabidin KURT

Pages : 429-437

Doi:10.20289/zfdergi.1081067

View : 56 | Download : 14

Publication Date : 2022-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı fitoplazma belirtisi gösteren biberlerde fitoplazma etmeninin grup/alt grubunu araştırmaktır. Materyal ve Yöntem: Bu çalışmada, 2020 yılında Iğdır ilinden toplanan bitkiler direct ve nested PCR testleri kullanılarak analiz edilmiş ve BLASTn, iphyClassifier, Mega 7 ve pDRAW32 programları kullanılmıştır. Araştırma Bulguları: Testlerde, fitoplazmaya spesifik yaklaşık 1.2 kb DNA fragmentleri elde edilmiştir. Belirlenen 16S rRNA nükleotit dizisi (1254 bp) (OM663745) %99.44'ten fazla diğer ‘Ca. P. trifolii’ üyelerine nükleotit benzerliği göstermiştir. Gerçekleştirilen Sanal RFLP ve filogenetik analizler simptom gösteren biber bitkilerinde Clover proliferation group (16SrVI) grubu ve A alt grubundaki ‘Ca. P. trifolii’ etmeninin infeksiyonunu kanıtlamıştır. Sonuç: Türkiye’nin Iğdır ilinde doğal olarak enfekte olmuş biberlerde ‘Ca. P. trifolii’ varlığı PCR-RFLP ve kladistik analiz kullanılarak tespit edilmiştir.
Keywords : Clover proliferation group 16SrVI, Nested PCR, Capsicum annuum, RFLP

ORIGINAL ARTICLE URL